Es la instancia del PROCISUR a nivel país y está integrada por el CATI y los miembros que la Institución participante considere necesarios a fin de asegurar una mejor integración entre la planificación de cada institución y el PROCISUR. Su institucionalización en la estructura organizacional del Programa se da a partir del PMP 2015 - 2018, con la función de analizar y acordar los temas que se eleven desde la Institución de cada país al PROCISUR y viceversa, actuando como ámbito de ordenamiento y coordinación de las demandas. Las propuestas de los planes anuales de trabajo y del equipo técnico deberán contar con un proceso de socialización y análisis con las Mesa País, para elevar a consideración de la CD.